益生菌冻干粉的副作用会比较少，一般是不会给人体健康带来副作用的，但是极少数人群会产生一种依赖性。
益生菌冻干粉主要可以提高人体的免疫功能，并且还可以有效的抑制有害菌的生长，但是有部分人群会长期的使用，在长期服用的情况下就有可能会产生一定的依赖性，也会扰乱自身免疫系统的发育，对于肠道的健康也会造成一些影响，比如会导致腹部出现疼痛感，也有部分人群也会出现腹泻或者是大便止泻等一些症状，在日常生活当中，尽量不要长时间的使用益生菌冻干粉，在使用一段时间之后应该停止，这样可以降低对人体健康的伤害程度。
益生菌冻干粉在临床上面主要用来治疗腹泻以及过敏，对于胃口不佳，治疗效果也是比较好的，并且还可以促进肠道的蠕动，能够有效的改善肠道蠕动缓慢所引起的一些症状，比如便秘或者是大便排不出，对于免疫力低下改善效果也是比较好的，可以提高自身的免疫功能，并且还可以防止身体上面发生一些疾病，但是不能够长期之间或者是大量的使用。
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