我遇到过这种情况的，首先，你单位相关制度有没有规定什么情况算自动离职呀，我们明文规定3日未履行任何请假手续不到岗上班算自动离职的，下面向你介绍下我怎么做的吧：
我们上班是需要打卡的，员工三天不到岗上班，考勤有三天缺勤的记录，我们一般再等个两三天，然后电话通知本人告知其要到岗上班，如果他接电话的话，我们有电话记录或电话录音；如无法接通进入下一步骤；
电话通知过或未打通电话，公司发文写明该员工违规情况，按规定予以解除劳动合同，公司有该员工的通讯地址，将文件按地址寄双挂号带回执的挂号信，凭挂号信回执及解除劳动合同的通知，到劳动保障局解除劳动合同，然后办理社保减少手续。
希望对你帮助。
答案补充
一定要先解除合同才能停保的，要不然，你单位与他签订的合同仍然有效，却不给他交社保，这不是违法吗？
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