农村基层组织是实现党在农村领导的基石，是贯彻落实党的各项方针政策的基础，是维护基层社会稳定的防火墙。随着新形势的变化，农村工作的内容、形势、重心都在不断发生变化，农村基层组织也面临着一些新情况、新问题。如何加强新形势下的农村基层组织建设工作，是一个事关农村经济发展、社会稳定的重要问题。
一、存在问题
（一）农村干部管理难度加大。一是村干部缺乏工作积极性。目前，农村干部工作紧，任务重，待遇低，平均月工资约为120元左右，又没有养老、医疗等保障，这严重挫伤了村干部的工作主动性。二是退休村干部干扰村务工作。据调查，全乡共有退休村干部40余人，他们每年集合四次，每人集资200元做活动经费，并产生了会长、副会长。有的退休村干部自认为年龄大、威望高，在村级班子建设、自身利益维护、村务工作管理等方面向乡村两级施压，提条件，提要求，严重干扰了村级工作正常开展，他们已形成一个不可忽视的团体，如果处理不当，势必影响全乡社会稳定大局。
（二）部分支村两委关系不和。一是书记、主任“两层皮”现象。支部和村委会各行其事，各干各的工作，互相扯皮，形成“两套人马”，以至于不能很好地发挥其他成员的作用，严重影响班子的协调和稳定。二是脱离支部领导，片面强调村民自治。一些村委会认为，自己是自治组织，其干部是通过村民民主选举而产生的，不需要别的组织来监督管理，把“群众拥护”当作“护身符”，因而部分村委会往往出现凌驾于党组织之上，呈现出我行我素，不服领导的现象，比如，我乡某村新当选的村委会主任，没有征求党支部的意见，私自任命了一名村会计，在群众中造成了极坏影响。三是全局观念差，服务意识薄。有的村干部是靠家族势力当选的，所以工作中缺乏全局观念，不是为全体村民服务，而是为个人利益服务，为家族利益服务。更有甚者，班子搞内耗，支书告村长，村长告支书，相互拆台，严重影响了社会稳定，损坏了经济发展。
（三）村干部作风还不够扎实。当前，部分村干部组织群众、引导群众的能力素质明显滞后于农村发展需要。一是缺乏超前思维意识。在政策理解上存在片面性和孤主性，对工作缺乏前瞻性和整体性，就事论事多，处于被动状态。二是缺乏做群众工作本领。一些年轻干部缺乏做群众思想工作的能力，平时感情投入少，与群众接触少，不熟悉，对热点、难点问题不能吃透政策，不能说服群众；解决群众困难作风虚浮，害怕吃苦受累，采取视而不见或一拖再拖的办法。三是缺乏研究解决农村突出问题能力。主要体现在学习不够，政策掌握不透。有的甚至存在片面的群众观念，不依纪依法办事。