1、 规章制度的制定要符合法律法规，不能违法和侵犯员工切身利益。如一些公司规定，员工辞职，要支付违约金的条款，自《劳动合同法》实施后属于违法条款，即使在规章制度中约定，也会因违法而无效。这些违反法律法规的制度，不但造成管理上的问题，更容易使公司遭受劳动监察部门的查处。
2、 公司按照法律或者规章制度行使“劳动合同解除权”，必须有法可依，有规可循，制定切实符合法律规定的量化的规章制度。严重违纪，必须达到一定得程度，必须对员工的违纪行为进行量化。所谓量化，如“当月累计7次迟到”，“连续旷工3天”，“造成公司损失达5000元以上的”等等，不能只有“禁止”而没有“责任”。
3、 规章制度制定不严谨，导致员工以规章制度为依据提起诉讼。如“每日工作10小时”，“周六上班”等，尽管公司每天工作时间没有达到10小时，但员工如果以公司没有支付每日2小时加班费，可以得到法律支持。
4、 制定的规章制度应公示。制度不但应公示，还应该员工需要签字确认，收到规章制度，并愿意遵守。若规章制度制定后，即使员工看过，但如果双方发生纠纷，员工认为规章制度其不知道，公司没有告知，那么公司很容易承担败诉的结果。
5、 严格执行规章制度，员工有违反规章制度，必须做出处理。“通报批评“、“警告”、“惩戒”、“留岗查看”、直至“解除合同”。不能放任员工多次违纪，而仅以“口头”批评警告，口头的警告在法庭上不能作为证据使用。
6、 规章制度应当前后统一，规章之间应当互相配合，不能出现矛盾和冲突，同时应保证规章制度的稳定和连续，不能早令夕改。尤其涉及员工利益的部分，如果变更，极易引起相关岗位的员工发生集体劳动争议。
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